Từ những năm 1966 - 1968, trường chưa được thành lập nên học sinh lúc đó phải đi học nhờ ở các xã bạn như Quỳnh Trang, Quỳnh Văn.

   Đến năm học 1968 – 1969, trường mới có một phân hiệu của trường Quỳnh Văn tách ra gồm có 2 lớp: 1 lớp 5 và 1 lớp 6. Giáo viên lúc đó chỉ có 3 người: thầy Khoan, thầy Sơn, cô Lợi.

   Đến năm học 1971 – 1972, lúc đó chưa thành lập xã Quỳnh Tân nên trường được mang tên Trường cấp II Văn Xuân. Hiệu trưởng là thầy Hồ Xuân Tựu. Lúc mới thành lập trường có 4 phòng nhà cấp 4 lợp ngói. Nhưng do chiến tranh ác liệt trường phải sơ tán đến các lán trại để học (tại vùng Trạm xá hiện nay). Đến hết tháng 12 năm 1972 lại chuyển về trường ngói để học.

   Vào ngày 2 – 4 – 1973 xã Quỳnh Tân thành lập và vào ngày 5 – 9 – 1973 Trường cấp II Quỳnh Tân được thành lập (đổi tên từ trường Cấp II Văn Xuân). Lúc đó trường có 5 lớp và hiệu trưởng là cô Nguyễn Thị Tý.

   Năm học 1975 – 1976, hiệu trưởng là thầy Nguyễn Văn Châu, một năm sau thầy Châu đã đi công tác tại Miền Nam.

Từ năm 1976 – 1978 thầy Võ Ngọc Hoàn làm hiệu trưởng.

Từ năm 1978 – 1980 thầy hiệu trưởng là thầy Vũ Duy Thường.

Từ năm 1980 – 1983 thầy Nguyễn Duy Khóa làm hiệu trưởng.

Từ năm 1983 – 1992 thầy Đinh Xuân Thắm làm hiệu trưởng.

Từ năm 1992 – 1994 cô Lê Thị Quỳnh Liên làm hiệu trưởng.

Từ năm 1995 – 2004 thầy Đinh Xuân Thắm trở lại làm hiệu trưởng.

Từ năm 2004 đến nay hiệu trưởng là thầy Nguyễn Đình Quông.

   Vào năm 1997, được sự quan tâm của địa phương, trường chúng ta đã có dãy nhà 2 tầng gồm 11 phòng học. Từ đó đến nay, trường không ngừng phát triển về cơ sở vật chất và chất lượng học tập của học sinh cũng được nâng lên rõ rệt.

   Các phong trào hoạt động Đội rất phong phú và đa dạng, nề nếp đạo đức của đội viên vẫn được duy trì tốt.